O tema ciência, tecnologia e inovação (CT&I, ) é assunto obrigatório nas agendas das políticas públicas de todas as nações que reconhecem que a economia globalizada é movida pela capacidade que os países e empresas têm de inovar em produtos e processos. Sendo assim, este trabalho de tese tem o seu foco no entendimento de como foi construída institucionalmente a política pública de apoio a ciência, tecnologia e inovação no período de 1999 a 2010 e compreender o papel da Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP) como uma das principais agências responsáveis pela implementação das políticas públicas e em especial como secretaria executiva do Fundo Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (FNDCT). Utilizar-se-á da abordagem institucionalista que busca analisar o processo econômico como um fenômeno social através das relações interdependentes entre os vários atores sociais, que é uma proposta alternativa aos métodos econômicos tradicionais.