Wie immer führt Special Agent Jethro Gibbs (Mark Harmon) sein NCIS-Team in unsicheres Gewässer, um sein Land zu schützen - vor einem biologischen Anschlag, einem Bombenattentat auf ein Krankenhaus und vor einer Terrorgruppe, die sich "Bruderschaft des Zweifels" nennt. Nie zuvor wurden die Ermittler auf so harte Proben gestellt: Ein Teammitglied wird die Geisel eines frei herumlaufenden Terroristen und die Rückkehr des berüchtigten "Privileged Killers" führt die Ermittler in einer Doppelepisode bis nach New Orleans.