Casey Jones legt es auf den ultimativen Kampf gegen das Böse an, die Turtles erfahren ein schreckliches Geheimnis über Aprils Vergangenheit und sie bekommen es mit fiesen Rivalen zu tun: dem neuen Schildkröten-Mutanten Slash, einem neu verkabelten Metalhead, einem Pilz-Mutanten, der die Kanalisation verpestet, und nicht zuletzt auch mit dem Rattenkönig ...