Mit der Eisenbahn geht es für Familie Pteranodon und ihre Freunde wieder auf Erkundungstour durch das Erdmittelalter, wo sie viele neue unbekannte Orte und Arten kennenlernen. In Staffel 5 reisen die Kinder mit dem Schaffner in die frühe Jura-Zeit. Die Dino-Familie trifft diesmal neben vielen Sauriern auch auf Säugetiere. Buddy verbringt seine Ferien bei einer Tyrannosaurus Rex Familie. Außerdem geht es mit selbstgebauten Flügeln hoch hinaus, mit einem U-Boot unters Wasser und mit einem Bohrzug in die Zukunft, wo sie auf einen ganz besonderen Artgenossen treffen.